MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori B38 chromosome

Total Repeats: 5224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012973	CAT	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012973	T	6	6	78	83	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012973	T	7	7	2522	2528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012973	GGT	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012973	TAT	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012973	TGG	2	6	4269	4274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012973	ATGC	2	8	4373	4380	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012973	TGG	2	6	4389	4394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012973	GTG	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012973	ACC	2	6	4536	4541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_012973	GGT	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012973	A	7	7	4670	4676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012973	T	8	8	4690	4697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012973	AAT	2	6	4711	4716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012973	TAAA	2	8	4780	4787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012973	A	6	6	4860	4865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012973	TTA	2	6	4889	4894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012973	T	7	7	4906	4912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012973	A	6	6	4917	4922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012973	A	6	6	4933	4938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012973	GTTTT	2	10	4943	4952	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012973	TGT	2	6	4972	4977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012973	TTTTA	2	10	4991	5000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012973	A	8	8	5042	5049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012973	A	7	7	5056	5062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012973	A	6	6	5073	5078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012973	AAATT	2	10	7154	7163	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012973	TAAG	2	8	7186	7193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012973	T	12	12	7225	7236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012973	T	6	6	7267	7272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012973	TTTG	2	8	7278	7285	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012973	GGT	2	6	7286	7291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012973	T	6	6	7353	7358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012973	AGCG	2	8	7375	7382	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012973	C	6	6	7397	7402	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_012973	A	6	6	7403	7408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012973	AGA	2	6	7433	7438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012973	GA	3	6	7437	7442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012973	GAT	2	6	7454	7459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012973	TAA	3	9	9129	9137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012973	ATAA	2	8	9521	9528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012973	TTA	2	6	9551	9556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012973	ACTATA	2	12	9615	9626	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012973	ATT	2	6	9630	9635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012973	TA	3	6	9645	9650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012973	CAA	2	6	9698	9703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012973	TATT	2	8	9720	9727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012973	A	6	6	9758	9763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012973	AAAG	2	8	9771	9778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012973	T	7	7	12523	12529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012973	AGG	2	6	12594	12599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012973	GCTTT	2	10	13452	13461	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_012973	T	6	6	13459	13464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012973	T	7	7	13521	13527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012973	ATA	2	6	13531	13536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012973	TTAA	2	8	13550	13557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012973	ATT	2	6	16503	16508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012973	CA	3	6	16538	16543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012973	CTG	2	6	16559	16564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012973	CCA	2	6	18133	18138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_012973	AAACAC	2	12	18172	18183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012973	ATCA	2	8	22581	22588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012973	TAT	2	6	22787	22792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012973	TTTCTT	2	12	22802	22813	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012973	TGA	2	6	22832	22837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012973	T	6	6	22923	22928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012973	GC	3	6	22939	22944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012973	CTTG	2	8	22969	22976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012973	GGT	2	6	22977	22982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012973	TTTA	2	8	23012	23019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012973	A	6	6	23026	23031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012973	T	6	6	23044	23049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012973	A	6	6	23069	23074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012973	TTTG	2	8	23076	23083	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012973	A	6	6	23088	23093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012973	A	6	6	23096	23101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012973	A	6	6	23156	23161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012973	TTA	2	6	25350	25355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012973	GATT	2	8	25366	25373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012973	TAAG	2	8	25405	25412	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012973	ATTA	2	8	25463	25470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012973	A	15	15	25488	25502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012973	GTT	2	6	25564	25569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012973	A	7	7	25587	25593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012973	GTT	2	6	25610	25615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012973	TGT	2	6	25623	25628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012973	AGCCT	2	10	25855	25864	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_012973	ATA	2	6	27170	27175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012973	A	6	6	27197	27202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012973	T	6	6	27233	27238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012973	A	7	7	27276	27282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012973	TA	3	6	27296	27301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012973	T	6	6	28635	28640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012973	A	7	7	28661	28667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012973	GGTT	2	8	31665	31672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012973	T	8	8	37342	37349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012973	TTA	2	6	37351	37356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012973	T	6	6	37368	37373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012973	A	7	7	37401	37407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012973	TAA	2	6	40328	40333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012973	A	7	7	40338	40344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012973	AG	3	6	40349	40354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012973	A	6	6	41786	41791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012973	TAA	2	6	41794	41799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012973	TAA	2	6	41808	41813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012973	CAAA	2	8	43985	43992	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012973	T	6	6	44043	44048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012973	ATC	2	6	44049	44054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012973	T	6	6	44069	44074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012973	CAC	2	6	44081	44086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_012973	TAGTA	2	10	44124	44133	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012973	GACTTA	2	12	44134	44145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_012973	A	7	7	44161	44167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012973	T	6	6	49221	49226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012973	GGCTAG	2	12	49244	49255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_012973	AGG	2	6	49259	49264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012973	TTGC	2	8	49280	49287	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012973	GGC	2	6	49343	49348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012973	GT	3	6	49417	49422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012973	TGG	2	6	49426	49431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012973	TTG	2	6	49475	49480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012973	TGGT	2	8	49563	49570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012973	TGG	2	6	49575	49580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012973	AAT	2	6	49642	49647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012973	CTT	2	6	49729	49734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012973	CAAG	2	8	49815	49822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_012973	T	7	7	49844	49850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012973	T	6	6	49855	49860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012973	A	6	6	49877	49882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012973	TCA	2	6	49983	49988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012973	CAC	2	6	50002	50007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_012973	TAAAA	2	10	50096	50105	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012973	A	6	6	50102	50107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012973	TTTG	2	8	50119	50126	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012973	ATCAA	2	10	50127	50136	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012973	TAAAC	2	10	50329	50338	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012973	TTTA	2	8	55438	55445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012973	T	6	6	55509	55514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012973	TAAT	2	8	55538	55545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012973	TAA	3	9	55644	55652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012973	TTAAA	2	10	55709	55718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012973	ACAA	2	8	55738	55745	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_012973	G	10	10	55989	55998	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012973	ATA	2	6	55999	56004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012973	AAC	2	6	56036	56041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012973	GTG	2	6	56084	56089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012973	AAT	2	6	56110	56115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012973	C	8	8	56160	56167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
149	NC_012973	AAT	3	9	56168	56176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012973	A	6	6	56219	56224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012973	AGA	2	6	56227	56232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012973	AGA	2	6	56242	56247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012973	TAG	2	6	58168	58173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_012973	T	7	7	122166	122172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_012973	TTGT	2	8	122361	122368	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_012973	T	7	7	122436	122442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_012973	GTTCTA	2	12	122446	122457	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
449	NC_012973	TAA	3	9	122492	122500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_012973	CCA	2	6	122531	122536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
451	NC_012973	TTGAT	2	10	122538	122547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
452	NC_012973	TAC	2	6	122627	122632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_012973	GCC	2	6	122637	122642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
454	NC_012973	T	7	7	122660	122666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_012973	CT	3	6	122680	122685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
456	NC_012973	A	6	6	122699	122704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_012973	CCA	2	6	122706	122711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
458	NC_012973	TTA	2	6	122831	122836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_012973	T	6	6	122843	122848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_012973	A	6	6	122850	122855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_012973	ATA	2	6	125409	125414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_012973	TAA	2	6	125466	125471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_012973	GTTA	2	8	125515	125522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
464	NC_012973	GGT	2	6	125542	125547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
465	NC_012973	AAAG	2	8	128420	128427	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
466	NC_012973	GTTTTA	2	12	128804	128815	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
467	NC_012973	A	6	6	128820	128825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_012973	AAAG	2	8	128915	128922	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
469	NC_012973	TAG	2	6	128931	128936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
470	NC_012973	GAAG	2	8	128972	128979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
471	NC_012973	ATT	2	6	130042	130047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_012973	ATA	3	9	130055	130063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_012973	GAT	2	6	130154	130159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_012973	T	8	8	130710	130717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_012973	GGT	2	6	130947	130952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
481	NC_012973	T	6	6	130952	130957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_012973	AGA	3	9	130964	130972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
483	NC_012973	AG	3	6	130980	130985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
484	NC_012973	GAA	2	6	130991	130996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
485	NC_012973	TTG	2	6	131009	131014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
486	NC_012973	ATTA	2	8	131022	131029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_012973	T	6	6	132020	132025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_012973	TAA	2	6	135284	135289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_012973	A	7	7	135295	135301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_012973	TAA	2	6	135305	135310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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